同源染色体是指来自于不同的祖先，由于多代近亲结婚生育而传递到了同一后代中的相同染色体区域。在同源染色体区域，由于不同个体独立进化的原因，如果出现点突变，导致携带同源染色体的近亲之间某些遗传病的携带者率增加，后代患病率亦将增加。
常见的同源染色体疾病包括先天性耳聋、地中海贫血、血友病等。这些疾病因为携带率高而成为了家族聚集病，又因为携带同源染色体的亲戚较近，所以又叫近亲婚姻遗传病。
想要减少同源染色体疾病患病率，首先要引起的就是家族成员的重视。特别是有早期家族聚集性疾病史的家庭，必须从严控制近亲通婚，避免受遗传病影响的后代出现。此外，遗传咨询机构这种对遗传病进行基因检测、婚姻咨询和产前选育的机构也可以提供及时而有效的保障。